براساس استاندارد های جهانی مانند استاندارد WHO، آب آشامیدنی باید فاقد بار میکروبی و ترکیبات پاتوژن باشد از این رو همواره سازمان های تامین آب شرب استفاده از روش های گندزدایی را برای حذف بار میکروبی را دستورکار دائم خود قرار می دهند.
اما باید توجه داشت که همواره گندزدایی به معنی حذف تمامی پاتوژن ها نیست و از سوی دیگر در خطوط انتقال آب هرگونه شکستگی خط لوله و برداشت های غیر مجاز از آب می تواند منجر به ورودی بار میکروبی جدید به آب شود. با توجه به اینکه این پاتوژن ها به شدت برای سلامت افراد جامعه خطر ساز است، پایش کیفی دائم کیفیت آب اهیمت بالایی دارد.
با توجه به اینکه پایش و اندازه گیری بسیاری از انواع پاتوژن ها مانند ویروس ها یا تک یاختگان بسیار زمان بر و پرهزینه است، در سراسر دنیا امروزه پایش باکتری هایی از جمه E-Coli و کلیفرم به عنوان شاخص بررسی کیفیت بار میکروبی آب به کار می روند.